（1）细菌性痢疾：早期肠套叠病例可误诊为菌痢。

    （2）蛔虫肠梗阻：其症状可与肠套叠相似，腹内肿块多在脐下、腹中央，有时呈索条状。这些都与肠套叠有所不同。

    （3）过敏性紫癜：腹部紫癜可伴发肠套叠，故当腹部症状越来越严重时，则需警惕肠套叠的可能。

    （4）直肠脱垂：直肠脱垂时，可以清楚地看到肠黏膜一直延续到肛门周围的皮肤，而肠套叠时，在肛门口与脱出的肠管之间有一条沟，可以通过此沟将手指伸入直肠内，而且直肠脱垂并无急腹症症状。

    （5）其他：梅克尔憩室并发出血、结肠息肉脱落出血及肠内外肿瘤等引起的出血或肠梗阻，都可能与肠套叠混淆，必须特别警惕。