生物碱的溶解性与生物碱分子结构中氮原子的存在状态、分子大小、分子中极性基团的种类和数目以及溶剂的种类有关。

　　（一）游离生物碱

　　1.亲脂性生物碱

　　多数具仲胺和叔胺氮原子的生物碱有较强的脂溶性，易溶于乙醚、苯和卤烃类（二氯甲烷、氯仿、四氯化碳等）等有机溶剂中，尤其在氯仿中溶解度较大；医学|教育网搜集整理可溶于甲醇、乙醇、丙酮、乙酸乙酯等；不溶或难溶于水，但易溶于酸水。

　　2.亲水性生物碱

　　（1）季铵型生物碱

　　这类生物碱为离子型化合物，易溶于水和酸水，可溶于甲醇、乙醇、正丁醇等极性较大的有机溶剂，难溶于亲脂性有机溶剂。

　　（2）含N-氧化物

　　结构的生物碱这类生物碱具配位键结构，可溶于水，如氧化苦参碱。

　　（3）小分子生物碱

　　少数分子较小而碱性较强的生物碱，既可溶于水，也可溶于氯仿，如麻黄碱、烟碱等。

　　（4）酰胺类生物碱医学|教育网搜集整理

　　酰胺在水中可形成氢键，所以在水中有一定的溶解度，如秋水仙碱、咖啡碱。

　　3.具有特殊官能团的生物碱

　　（1）具有酚羟基或羧基的生物碱

　　这类生物碱称为两性生物碱，既可溶于酸水，也可溶于碱水溶液。具有酚羟基的生物碱（常称为酚性生物碱），可溶于氢氧化钠等强碱性溶液，如吗啡；具有羧基的生物碱可溶于碳酸氢钠溶液，如槟榔次碱。

　　（2）具有内酯或内酰胺结构的生物碱

　　这类生物碱在正常情况下，其溶解性类似一般叔胺碱，但在强碱性溶液中加热，其内酯（或内酰胺）结构可开环形成羧酸盐而溶于水中，酸化后环合析出。如喜树碱、苦参碱等。

　　特殊情况：

　　如吗啡为酚性生物碱，但难溶于氯仿、乙醚；石蒜碱难溶于有机溶剂，而溶于水；喜树碱不溶于一般有机溶剂，而溶于酸性氯仿等。

　　（二）生物碱盐

　　生物碱盐一般易溶于水，可溶于甲醇、乙醇，难溶或不溶于亲脂性有机溶剂。

　　生物碱在酸水中成盐溶解，调碱性后又游离析出沉淀，可利用此性质提取分离生物碱。

　　生物碱盐在水中的溶解性因其成盐的种类不同而有差异。

　　生物碱的无机酸盐＞大于有机酸盐医学|教育网搜集整理；

　　无机酸盐中含氧酸盐＞大于卤代酸盐；

　　小分子有机酸盐大＞大分子有机酸盐。

　　某些生物碱盐难溶于水，如小檗碱盐酸盐、麻黄碱草酸盐等难溶于水。