港澳中医医师内地短期行医执业注册需提交的材料如下：

　　（一）港澳医师在内地短期行医执业注册申请；

　　（二）港澳永久居民身份证明材料；

　　（三）近6个月内的2寸免冠正面半身照片2张；

　　（四）与申请执业范围相适应的医学专业最高学历证明；

　　（五）港澳医师的行医执照或者行医资格证明；

　　（六）近3个月内的体检健康证明；

　　（七）无刑事犯罪记录的证明；

　　（八）内地聘用医疗机构与港澳医师签订的协议书；

　　（九）内地省级以上人民政府卫生行政部门规定的其他材料。